神奇宝贝特别篇是由日下秀宪作脚本，真斗和山本智作画的漫画作品。系列原作日下秀宪，其前九册由真斗作画。后真斗因病而不能继续参与创作，山本智接手系列的作画工作，此后一直持续。目前最新章节是“X·Y篇”。全部章节加起来已经连载了500回以上。
神奇宝贝特别篇的剧情围绕着口袋妖怪主系列游戏的剧情展开，包括了漫画主人公在游戏对应地区历险、挑战地区道馆、参加神奇宝贝联盟、与地区中传说的神奇宝贝们邂逅的故事。
田尻智说：“这个漫画和我想要表达的世界是最为接近的 ”。
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